Smakämnen chokladallergi är möjliga även om de är det rares. Det allergiska fenomenet i detta fall kommer från proteinerna från kakao. Den allergiska personen som konsumerar det upplever då andningssvårigheter, har huvudvärk, utslag, takykardi, klåda och en brännande känsla i magen.

Dessa symtom kan också observeras hos personer som är allergiska mot de element som utgör choklad (nötter, mjölkproteiner etc..), även om de därför inte är allergiska mot kakao i sig.