A samkultur är en avföring undersökning som består i att leta efter närvaron av bakterier. Det gör det möjligt att hitta orsak till akut bakteriell diarré och bättre målinriktad antibiotikabehandling.

Un parasitologisk undersökning av avföringen kan också göras för att kontrollera förekomsten av parasiter.

La samkultur ordineras för akut diarré som tyder på bakteriell infektion, i fall av:

• minst tre lös eller vattnig avföring per dag i mer än 24 timmar och mindre än 14 dagar
• feber högre än eller lika med 40 °C,
• förekomst av slem eller blod i avföringen,
• buksmärtor,
• återvänder från en resa till ett land där bakteriell diarré är frekvent (endemiskt område)
• diarré som uppstår hos en inlagd patient (risk för nosokomial diarré på grund av Clostridium difficile)
• kollektiv matförgiftning (TIAC)

Man bör dock komma ihåg att de flesta akuta gastroenteriter är av viralt ursprung; rotavirus är ansvariga för mer än 50 % av fallen, särskilt hos spädbarn. Avföringskultur har inget intresse av dessa fall.

Vid kronisk diarré är avföringsodling också onödig.

Undersökningen består av att ta ett litet prov (cirka 10 till 20 g) avföring.

Tillvägagångssätten kan skilja sig åt beroende på analyslaboratorierna och provet kan tas på plats eller hemma. Oftast förses patienten med en steril behållare och en liten spatel för provtagning. Sadeln ska läggas på en ren sopsäck placerad över toalettskålen eller i en speciell bassäng. Vanligtvis medföljer handskar: det räcker då att ta en liten mängd, stoppa in den i de medföljande krukan(erna) och evakuera resten av pallen i toaletten.

Provet bör förvaras i kylen och föras till laboratoriet så snabbt som möjligt (om det inte hämtas på plats).

Hos spädbarn eller barn samlas avföring upp med en pinne.

I laboratoriet kommer avföringen att analyseras (odlas) för att leta efter ett tiotal bakterier som är ansvariga för infektiös diarré, bl.a. salmonella (Salmonella), Shigella, campylobacterEtc.

Observera att Salmonella är den vanligaste orsaken till akut bakteriell matburen diarré. Beroende på resultatet kommer läkaren att föreslå en lämplig behandling.

Avföringsodlingen är endast positiv i 0,5 till 14 % av fallen, eftersom många diarréer är virala men också för att undersökningen inte alltid är lätt att utföra och tolka.